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25 noviembre 变换DNA先生是一个好吃懒做的家伙,平日里裹的严严实实,蜷缩在细胞大厦的指挥间里面。外面的事情他也不用亲去,家里里雇了不少的叫转录因子的丫鬟,管家,有事的时候禀告一声。DNA先生虽然懒的出去,但也不是昏了头,什么事也不管。再说,外面的事情还是得他说了算的。于是丫鬟,管家门准备好给先生松动松动裹着的棉被,再请来一个及其精准的绣像匠。绣像将拖着长长的尾巴,丫鬟们帮DNA先生伸手伸腿的量身段。不消一刻钟,几乎一抹一样的绣像加工好了。无耐,先生成日积累下来的坠肉脂肪在那绣像上看上去竟有写多余,出去也见不得人办不得事。于是,指挥间里忙活着请来了几个裁缝,给那绣像抽脂拉皮的捣鼓一阵,再戴个帽子,拖个尾巴,迎风一吹,竟也成了人性,有头有脸起来,自称mRNA先生。在一群保安的簇拥下,冠免堂皇的出去给DNA先生办事情去了,
DNA先生也没给mRNA先生什么圣旨,倒是把图纸划在他身上了,打打杀杀的事情不用他来干。让他去找一个叫ribosome的装机先生按着图纸给装一堆机器人帮着干事情。mRNA先生刚出门,还没有走远,头上的大帽子太惹眼,一下子就被ribosome歹了个正着。ribosome是个大块头,也真会做生意,先把围着mRNA的保安支开,然后就几个先生围着mRNA,两只大手一手拖着mRNA苗条细长的身体,一手抓着mRNA的远方表妹递过来的各色零件,码着mRNA身上的图纸,接口也都是插扒式的,很快机器人就找好了。
mRNA先生出门的时候还想这个活也还轻松,外派,也还不用真刀真枪的斗。没有想到,其实DNA先生阴着呢,那大块头的ribosome先生不是好惹的。几个回合下来,机器人是做的挺快,不过mRNA先生累着头拖着地。身边的保安门都被赶走了,临了,外面的花花世界没有好好逛逛,尾巴被人给剪了。最后,本来顾头不顾尾的mRNA先生一楞神,帽子也被人摘了。着了风,很快就化了。
探报到,外面乱事已经平息,mRNA先生为国捐躯。DNA先生连一滴眼泪都没有掉,丫鬟,管家门都下了,保姆门帮着把棉被裹裹紧,DNA先生又睡起懒觉来了。
19 noviembre 心理学与生活在复旦的第五年,寝室里有一个从生科院转到心理系去的师弟。我受之影响,觉得心理学是挺有意思的学问。在来美国之前,从国年路书摊上买了著名的心理学与生活的中文译版。这本书覆盖了心理学很多的方面,用很浅显的语言解释了很多心理学的现象和问题。没有全部看完,挑了些感兴趣的话题章节看了些,越看越有味道。我不知道心理学做为一门科学是不是落寞了,还是从来大家都是把他和心理医生,心里咨询联系在一起。我的感觉是,心理学绝对是一门很有意思的科学,确实很生活。
1. 心理学是一门科学。他有自身的理论体系。和生物学很相像的是他在早期很多也是观察纪录,后来才是开始做测试性试验。因为他是研究人本身的学科,所以和生物学很接近比较自然
2. 这本书很重视生物学研究对心理学的贡献。前面的几个章节讲的就是行为的生物学基础。
3.心理学研究人的意识,情感。这些东西的生物学基础就是人对外界事物的感知。现在神经生物学里面研究的很多和感觉有关的topic,在早期都是心理学研究的话题。
更高级的话题也在心理学中有比较成熟成体系的研究,尤其是人脑对感知信息的高级加工,形成比较高级的知觉(比如三唯视觉,知觉恒常,音乐等等)
4.心理学研究人的记忆和高级行为,利用反射和动机的理论来解释人的行为。归纳人学习记忆的模式。
5.对人作为整体的分析,研究人格的后天形成和人的社会性
有两点很显而易见:
很多但不是全部的心里学理论和话题都可以在生物学的角度上进行研究
很多的话题的对生物学研究是很大的挑战。但是心理学给我们从生物学角度理解人提供了一些很重要的基本框架
心理学与生活在复旦的第五年,寝室里有一个从生科院转到心理系去的师弟。我受之影响,觉得心理学是挺有意思的学问。在来美国之前,从国年路书摊上买了著名的心理学与生活的中文译版。这本书覆盖了心理学很多的方面,用很浅显的语言解释了很多心理学的现象和问题。没有全部看完,挑了些感兴趣的话题章节看了些,越看越有味道。我不知道心理学做为一门科学是不是落寞了,还是从来大家都是把他和心理医生,心里咨询联系在一起。我的感觉是,心理学绝对是一门很有意思的科学,确实很生活。
1. 心理学是一门科学。他有自身的理论体系。和生物学很相像的是他在早期很多也是观察纪录,后来才是开始做测试性试验。因为他是研究人本身的学科,所以和生物学很接近比较自然
2. 这本书很重视生物学研究对心理学的贡献。前面的几个章节讲的就是行为的生物学基础。
3.心理学研究人的意识,情感。这些东西的生物学基础就是人对外界事物的感知。现在神经生物学里面研究的很多和感觉有关的topic,在早期都是心理学研究的话题。
更高级的话题也在心理学中有比较成熟成体系的研究,尤其是人脑对感知信息的高级加工,形成比较高级的知觉(比如三唯视觉,知觉恒常,音乐等等)
4.心理学研究人的记忆和高级行为,利用反射和动机的理论来解释人的行为。归纳人学习记忆的模式。
5.对人作为整体的分析,研究人格的后天形成和人的社会性
有两点很显而易见:
很多但不是全部的心里学理论和话题都可以在生物学的角度上进行研究
很多的话题的对生物学研究是很大的挑战。但是心理学给我们从生物学角度理解人提供了一些很重要的基本框架
16 noviembre 终于有车了来美一年有余,磨磨蹭蹭的终于拿到了驾照,然后改掉了磨蹭的习惯赶在小秦之前把车给买了。感觉比较划算的一个deal, 2001年的PT cruiser, 开了不到40000mile.
开始自己开车的生活了。 10 noviembre 测序时代很久没有发学术贴了。今天的lab meeting本来老早就已经取消掉了。礼拜三,Brent突然发email说他想做一个talk,关于最近在nature上发的一些和人类基因组测序有关的东西。
问题很简单,人类基因组测序给出的是一个classical的序列图谱,每个不同的民族,不同的个人,除了identical twin以外都是不一样的。就算是identical twin, 发生somatic mutation的病理组织也会和正常体细胞不一样。在classical 基因图出来以后,一个更艰巨更实际更有颠覆性的就是resequencing. 针对每个个体,花比较小的代价,如何把他的基因都测出来。今年沃森的基因组被测出来了,454花了500,000刀。现在的高通量测序的手段主要有三个, Roche 的454, 做一次反应能产生hundreds of thousands个reads长度达500bp/read序列. illumina 的selexa millions of reads ,但是每个reads 很短,35个左右。还有一个更加高通量的,但是只能有24/reads的。 这些高通量的测序技术在最近几年内肯定会飞快的发展,比如illumina 的技术的reads长度的改善等等,这些技术的出现为个体基因组的resequencing提供的很好的技术平台。
我们讨论的paper是另外一方面的。因为人类基因组中,在做resequencing的时候,不是什么基因都要去测序的。我们是不是可以集中在1%的coding region 先。把高通量分离target genome region (比如所有的exon) 和高通量的sequencing mechine (比如selexia ) 联合起来工作。高通量分离genome region的手段是custom array. array象一个filter,把你要的基因都分离出来,然后扩增以后去做 sequencing.
一个多小时的讨论,很有意思,没有仔细的讲paper.大体的意思就是,将来几年内这个一套的东西会给传统的生物研究带来很新很具有颠覆性的东西, 07 noviembre 傻事一桩有一个问题一直在争论不休的,就是应该为明天而努力呢还是应该享受今天。一贯,我的做法就是说服自己为明天而努力。不过最近土人突然觉得不能活的到了明天收获的时候,不知道怎么打发日子。所以就准备计划感恩节的时候出去玩玩,不能只是去outlet买买衣服鞋子,也弄得累个半天。计划就这是这么酝酿出来了。
到了定机票的时候才发现自己真的是土人一个。还好土人面皮比较厚,msn上问了耗子,priceline 上bid了一张价格不算很好的去芝加哥的往返票。刚刚定完票,才觉得事情太顺利的时候,一俭告诉我说,感恩节是22号,不是28号,这个十一月有五个礼拜四。。。。。
幸运的是,我的PI对人很宽容,这种事情我在lab meeting上当作笑话说出来,就可以当作是向他交代了。
看来,土人感恩节还是要去outlet 买买衣服鞋子的 |
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